平成２３年６月２７日（月）からオンライン申請で不動産登記申請をした場合に、
登記完了証の書面交付ができるようになりました。

書面交付を希望する場合は、
オンライン申請の際に指定するとのことです。

詳しくは、下記サイトをご参照ください。

登記・供託オンライン申請システム　お知らせ

登記完了証の交付の方法について（法務省）

「不動産登記規則等の一部を改正する省令案」に関する意見募集のページに
改正後の登記完了証の記載例（PDF）があります。

オンライン申請の場合の登記完了証は、
具体的に申請情報も記載されることになるようです。
これなら、わりと意味があるかもしれません。